CHKBiotech z powodzeniem opracował zestaw do wykrywania nowych wariantów koronawirusa

Nowy wariant szczepu koronawirusa 501Y-V2 z Republiki Południowej Afryki
18 grudnia 2020 roku RPA wykryła mutanta 501Y-V2 nowego koronawirusa. Teraz mutant z Republiki Południowej Afryki rozprzestrzenił się na ponad 20 krajów. Eksperymenty wykazały, że powyżej mutantów nowego koronawirusa mogą występować inne warianty mutacji K417N / T, E484K i N501Y, które mogą zmniejszać zdolność neutralizującą przeciwciał neutralizujących osocze indukowanych szczepionką. Jednak w porównaniu z genomem referencyjnym Wuh01 (numer sekwencji MN908947), sekwencja 501Y.V2 zmutowanego genomu z Republiki Południowej Afryki ma 23 warianty nukleotydów. Ma tę samą mutację N501Y, co mutant Britain podtypu B.1.1.7, ale nadal zawiera mutacje w dwóch kluczowych miejscach E484K i K417N białka S, które mają potencjalnie istotny wpływ na zdolność wirusa do zakażania.

Nowy koronawirus jest jednoniciowym wirusem RNA, którego mutacje genomu są częstsze. Wykrywanie pojedynczego celu może łatwo doprowadzić do nieudanego wykrycia próbek o niskim obciążeniu wirusem i zmutowanych szczepów wirusa. Odsetek ponownych badań w przypadku pojedynczego pozytywnego wyniku w wykrywaniu celu może osiągnąć ponad 10%, co może zwiększyć obciążenie pracą i wydłużyć czas diagnozy. Wykrywanie wielu celów i wzajemna weryfikacja wyników każdego celu może zwiększyć wskaźnik wykrywalności i ułatwić wczesną diagnozę.

news1

Rysunek 1. Schematyczny diagram mechanizmu infekcji New Coronavirus

Nowy mutant koronawirusa B.1.1.7 z Wielkiej Brytanii
26 grudnia 2020 roku ukazała się pierwsza praca naukowa dotycząca Szczepu B.1.1.7. Institute of Hygiene University of London UK and Tropical Diseases potwierdził, że szczep B.1.1.7 jest bardziej zdolny do rozprzestrzeniania się niż inne szczepy, co stanowi ponad 56% (95% CI 50-74%). Ponieważ ten nowy zmutowany szczep ma bardziej oczywistą moc transmisji, kontrolowanie COVID-19 stało się trudniejsze. Następnego dnia University of Birmingham w Wielkiej Brytanii przesłał artykuł na temat MedRxiv. Badanie wykazało, że liczba kopii genów wirusa ORF1ab i N u pacjentów zakażonych zmutowanym szczepem B.1.1.7 (zanik genu S) była znacząco zwiększona; zjawisko to było monitorowane w populacji. Ten artykuł wskazuje, że pacjenci zakażeni mutantem B.1.1.7 z Wielkiej Brytanii mają znacznie wyższe miano wirusa, więc ten mutant może być również bardziej chorobotwórczy.

1

Rysunek 2. Sekwencja mutacji genomu zawarta w zmutowanym szczepie koronawirusa B.1.1.7 z Wielkiej Brytanii

2

Rysunek 3. Mutacja N501Y wystąpiła zarówno w Wielkiej Brytanii, jak iw RPA Warianty

Zestaw do wykrywania nowych wariantów koronawirusa
Firma Chuangkun Biotech Inc. z powodzeniem opracowała zestaw do wykrywania nowych wariantów koronawirusa B.1.1.7 i 501Y-V2.

Zalety tego produktu: wysoka czułość , jednoczesne wykrywanie 4 celów, obejmujących główne miejsca mutacji zmutowanego szczepu B.1.1.7 i zmutowanego szczepu południowoafrykańskiego 501Y.V2. Ten zestaw może jednocześnie wykrywać miejsca mutacji N501Y, HV69-70del, E484K i nowy gen S koronawirusa; Szybki test: od pobrania próbki do wyniku zajmuje tylko 1 godzinę i 30 minut.

3

Rysunek 4. Wykrywanie krzywej wzmocnienia wariantu COVID-19 Britain

4

Rysunek 5. Wykrywanie krzywej amplifikacji wariantu południowoafrykańskiego COVID-19

5

Rysunek 6. Krzywa amplifikacji nowego koronawirusa typu dzikiego

Nie jest jasne, w jaki sposób te mutacje kumulują nowy długoterminowy wpływ pandemii COVID-19. Ale to przypomina nam, że te mutacje mogą wpływać na skuteczność naturalnej odporności i odporności wywołanej szczepieniami. Przypomina nam również, że musimy przez długi czas stale monitorować nowego koronawirusa i aktualizować szczepionkę COVID-19, aby poradzić sobie z ewolucją nowego koronawirusa.


Czas postu: Mar-12-2021